在失物招领处工作的巡查部长天树悠（东山纪之饰）根本没有前往现场的机会，绝大多数时候都跟各种遗失物品打交道，偶尔接待一下前来参观的小学生还要被烦的不行。不过这并不代表他是个没有什么能力且无足轻重的小警察，他对细节的敏锐观察力和推断能力证明他那休眠许久的警魂仍未老去。某天，在协助临场警察解决了一起家庭主妇自杀案后，他被担任警视厅搜查一课12系系长的片冈正敏（吉田钢太郎饰）召到自己麾下。虽然贵为搜查一课，但是12系仿佛一个不受人待见的边缘所在，有能力和抱负的刑警先后离开，如今这里仅有沙村康介（高岛政宏饰）、山下巧（片冈爱之助饰）、永泽圭太（铃木浩介饰）、水田环（仓科加奈饰）等个性十足又没什么干劲的刑警。天树的到来，似乎终于改变了12系尴尬的局面……

看起来吊儿郎当的龙崎郁夫（生田斗真饰）是新宿第二警署破案率最高的王牌刑警，这一天令系出名门的搭档日比野美月（上野树里饰）大为光火。与此同时，盘踞在新宿的松江组若头段野龙哉（小栗旬饰）以生意人身份从事各种违法犯罪勾当，他总能在适当的时刻得到情报，逃脱警方一次次的搜捕。看起来分明行走在黑白两条道路上而没有任何交集的两人，竟然有着难以割舍的渊源。郁夫和小龙在少年时均在孤儿院长大，他们曾度过快乐无忧的童年，但是最最敬爱的结子老师（广末凉子饰）遇害给两人以沉痛打击。他们发誓一定要找出真正的凶手报仇，这对好兄弟以警察和黑道的身份，分头朝着最终的目标前进。绵亘多年的复仇之战，无间双龙蓄势待发……

平成20年，在静冈县的国道高架桥下发现了杀人事件。而调查此次案件的静冈县警裾野署的警察日下悟发现，在昭和49年时须藤就已经和妻子离婚、当时住在静冈年幼的儿子尾畑守因诱拐杀人案件而去世。这个事件的时效成立一年前的昭和63年，由静冈县警本部长榛康秀所发出的指示而成立了特别搜查班。此后，非正式编制却升入警视厅的重藤成一郎成为管理官，率领着六个有能力的警察再次展开调查。