炼金术，一种建立在等价交换原则基础上的科学，将物质进行理解、分解、再构造，将一种物品变成另外一种。但是，这样先进的技术却不能进行人体炼成，这是炼金术绝对的禁忌。可是，拥有极高炼金术天赋的爱德华（朴璐美配音）和阿尔冯斯（钉宫理恵配音）兄弟，因为对母亲极大的思念不惜触犯禁忌。而最终的代价却是，爱德华失去了一条手臂和一条腿，弟弟阿尔冯斯只能将灵魂依附在一副巨大的装甲之内。终于明白一切的兄弟俩，为了恢复原状，寻求更多的炼金术知识，成为国家炼金术师踏上了寻找终极炼金物品——贤者之石的旅程。在不断的探索中，两兄弟终于发现了贤者之石背后的真相，对身处的这个军事化国家也有了更深入的了解。此时，面对国家、民族、家庭……炼金术的未来究竟在何处。

故事发生在神世纪300年，主要讲述结城友奈是初中2年级学生，她天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子决定性不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系，本作正是以描写友奈等人的“勇者部”的活动为主。

故事以5个高中二年级学生的校园生活为主线，双胞胎兄弟浅羽悠太和佑希，和他们的青梅竹马——冢原要和松冈春，以及转校生橘千鹤。他们共同经历了一季的校园生活，今后的他们，将又迎来怎样美好的青春故事呢？新的学期又开始了，5个少年迎来了人生中第17个冬季。这天，他们一起去冢原要家吃饭，饭后他们决定都留下来过夜……圣诞节来临，他们又遇到怎么样的小状况呢……一个个温馨幽默的小故事，就这样每天在他们身边发生；个性不同的人物也一个个陆续登场……他们的生活看似一如既往的平淡，却在他们不经意的时候悄悄发生了变化。在吵吵闹闹、诙谐悠闲的日常中，折射出5个少年真真实实、美好温馨的青春岁月。

故事发生在遥远的未来，彼时，大陆板块的活动令海水渐渐淹没了日本的大部分国土，人们不得不在海上建造起新的都市。随着时间的推移，海上都市的规模越来越大，航路越来越复杂，为了维持秩序，一种人们称之为“蓝色人鱼”的新型职业渐渐被大众所接收和憧憬，这份光荣的职业亦成为了很多女子高中生们未来奋斗的目标。活泼开朗乐观向上的岬明乃（夏川椎菜配音）、沉默寡言外冷内热的宗谷真白（Lynn配音）、害羞内向但在熟人面前有着十分可爱的一面的立石志摩（古木望配音）、傲娇毒舌非常在意自己身高的西崎芽依（种崎敦美配音），这些个性迥异的女孩子们，是否能够实现她们心中的理想呢？

2013年，都市NO.6。这里是一个没有犯罪，没有疾病，没有战争，没有所谓痛苦和怨恨的理想国度。一直这么认为的12岁天才少年紫苑（梶裕贵配音）和母亲住在NO.6的高级住宅区，在一个暴风雨的夜晚邂逅了颠覆他世界观的人——伤痕累累，有戾气的少年老鼠（细谷佳正配音）。对老鼠感到好奇和好感的紫苑不但没有感到害怕还救了老鼠，结果被认为窝藏嫌疑犯，被剥夺了所有特权，继而沦为了公园管理员。经历了这场变故的紫苑对所生存的理想世界产生了怀疑，城市里也频繁发生恐怖的死人事件。而这些事件和NO.6有着千丝万缕的联系，愈发困惑的紫苑不知自己已处在生死边缘，在关键时刻，被四年不见的老鼠所救，来到了NO.6外圈的贫民区。在这里，紫苑逐渐认识到了NO.6的真相，而危险远没有离开他们……

春日新（松冈祯丞配音）是一名平凡的少年，某日，一场意外让他和堂妹春日圣（诹访彩花配音）一同被卷入了通往异世界的漩涡之中，在混乱中，新和圣失散了。为了找到圣，两人一同回到原来的世界中去，新追寻着种种线索进入了王立书册学院成为了那里的一名转校生。性格严谨彬彬有礼的浅见莉莉斯（原由实配音）、擅长暗杀拥有超强行动力的风间莱维（佐仓绫音配音）、拥有强大魔力拒人于千里之外的山奈弥勒（日笠阳子配音）、大大咧咧开朗好爽的不动秋音（柚木凉香配音）、懵懵懂懂沉默寡言的神无月爱琳（内田彩配音）、身份神秘特立独行的仓田唯（村川梨衣配音）和莉瑟罗特（东山奈央配音），在学院里，等待着新的是七位个性迥异的魔导书使者，在她们的陪伴下，有笑有泪的学院生活就此拉开序幕。

人，用自己的双手创造了众多的故事。喜悦，悲伤，愤怒，感动。故事会使人的感情动摇，让人着迷。然而，这只是作为一个旁观者的感情。如果，故事中的登场人物们有了自己的“思想”，那么对他们来说，创造出这些故事的我们会是神一样的存在吗？——为我们的世界带来变革吧。——为众神的土地带来制裁吧。“Re:CREATORS”谁都能成为“造物主”。