“在人前唱歌什么的，我……”虽然想唱，但是唱不出来。在家中闭门不出，默默持续歌唱的原圣歌队的出井天使。在过着平凡校园生活的天使面前突然出现的原管弦乐队指挥响春男。原先平静的天使的日常生活，因与春男的相遇一下子变得混沌…！

女子高中生音无小夜（喜多村英梨配音）有一个幸福的家庭和一群善良的朋友，虽然丧失了一年之前的全部记忆，但这并不妨害她享受眼前的快乐时光。在这个世界中，出现了一种名叫“翼手”的怪物，它们拥有永恒的生命，以鲜血为食，现在，这些怪物的存在逐渐威胁到了人类的安全。表面上来看，小夜和这些可怕的怪物似乎一辈子都不会有所交集，但在2005年的这一天，当那个漆黑的不详男子出现在小夜的面前时，一切都改变了。男子名叫哈吉（小西克辛配音），他的到来不仅改变了小夜的命运，也唤起了小夜丢失已久的回忆。为了保护世界和所爱的人，小夜拿起了武器，在哈吉的帮助下开始了同翼手的战斗。

因为父亲的再婚，十六岁的女高中生朝日奈绘麻（佐藤利奈配音）入住朝日奈家，她一下子多了十三个新兄弟！父亲和新的母亲住在别处，而绘麻和十三个兄弟生活在同一屋檐下。新生活第一天，迎接绘麻到来的是温柔的长男雅臣和年幼的末子弥。随后绘麻一一见过她的新兄弟，包括同卵双胞胎椿（铃村健一配音）和梓（鸟海浩辅配音），而且她还发现同班同学朝日奈侑介（细谷佳正配音）也成为了自己的兄弟。侑介对于绘麻的到来感到十分吃惊，他似乎对绘麻怀着不一般的情愫。十三个兄弟职业不同，性格各异，绘麻的到来，是否会对他们造成困扰？迎来二十岁生日的昂（小野大辅配音），酒后竟然说出了心里话……期待有朝一日可以被接纳的绘麻，会与十三个兄弟产生什么样的羁绊？

由于初中不幸的遭遇，个性十分要强认真的少年三桥廉（代永翼配音）放弃了良好的升学条件，决心单枪匹马远赴位于埼玉县的西浦高校就读。社团招新的当天，在半推半就之下，三桥加入了刚刚转型成功的棒球部担任投手的位置。一段高中校园中的热血棒球史诗就此展开。棒球队中，三桥结识了一帮志同道合的好友，在充艰苦的训练和激烈的比赛中，彼此结下了深厚的友谊。个性大大咧咧但又不失细腻的捕手阿部隆也（中村悠一配音），叛逆不羁又格外可靠地外野手花井梓（谷山纪章配音），视力惊人的三垒手田岛悠一郎（下野纮配音）等人，在教练百枝麻里亚（早水理沙配音）的带领下，他们向甲子园的荣誉不断的前进着。

国立爱丽丝研究机关学园本部不同于一般的学园，只招收具备特殊能力的学生，这种能力被称之为“爱丽丝”。因为好友今井萤（钉宫理惠配音）转学从乡间来到了城里的爱丽丝学园，无论如何也不想和萤分开的佐仓蜜柑（植村加奈配音）因此离家出走，跟随萤来到了学园。但没有超能力的她根本无法进入，被学院老师鸣海先生（石田彰配音）救助后，意外地开发了蜜柑的超能力，于是，机缘巧合下，蜜柑也进入了爱丽丝学园，达成了她和萤在一起的愿望。新学校的生活有喜有忧。蜜柑所具备的超能力被同学嗤笑为最无用能力，和其搭档的又是问题少年日向枣（朴璐美配音），不能见相依为命的爷爷，在各种挫折困难面前，蜜柑依然乐观应对，逐渐赢得了大家的喜欢，也收获了和枣的爱情，但前路依旧有各种困难在等着他们……

「僕が愛したすべての君へ」では、母親と暮らす高校生の高崎暦がクラスメイトの瀧川和音から声を掛けられたことをきっかけにストーリーが展開。85番目の並行世界から移動してきたという彼女は、その世界では2人が恋人同士であると告げるのだった。